Les directions nationales apportent un appui transversal en matière de ressources, de programmation, de législation, de statistiques et de communication.
- Direction des Ressources Financières et du Matériel (DRFM)
- Direction des Marchés Publics et des Délégations de Service Public (DMP/DSP)
- Direction des Études et de la Programmation (DEP)
- Direction des Ressources Humaines (DRH)
- Direction de la Législation (DL)
- Direction des Archives, de la Documentation, de l'Information et des Relations Publiques (DAID/RP)
- Direction des Statistiques (DS)
- Direction de l'Action Coopérative, de la Promotion des Organismes Ruraux et des Organisations des Éleveurs (DACPOR/OE)